脈沖布袋吸塵器可采用在線清灰和離線清灰兩種方法。除塵器在線清灰是指在進行脈沖噴吹時，除塵濾袋仍然進行煙氣過濾。噴吹系統需要用采用比較高的噴吹氣流阻擋過濾煙氣，同時用瞬間的脈沖振蕩使除塵布袋塵層剝落進入灰斗。在線清灰除塵器內部是一個大空間靜態氣室，氣流分布比較均勻，使濾料所承受的過濾負荷變化不太大，這樣可延長濾袋使用壽命。
吸塵器離線清灰系統需要將吸塵器內部分為幾個密封袋室，每個袋室的花板上出氣口獨立設置氣缸離線閥、氣缸和電磁閥等壓縮氣控制系統。在對每個袋室進行脈沖清灰噴吹前，需要首先控制離線閥使這個袋室不再進行煙氣過濾。因此，離線清灰機構比較復雜，而且帶有氣缸離線閥門，所以離線清灰除塵器的造價與維護量相對來說比在線清灰除塵器稍高。
事實上，應根據煙氣的性質和工藝要求，靈活選擇在線或離線清灰系統設計。在一些特殊的技術，如垃圾焚燒等，其煙塵性質松散，不易產生餅塊，有效清灰也很困難。采用離線清灰方法可以減少二次灰塵，使除塵階段更加全面，達到降低除塵設備阻力的效果。
但另一方面，離線除塵器完成袋室除塵后，該袋式過濾袋的阻力低于其他過濾的氣室除塵過濾袋的阻力。這時候打開離線閥門，袋室內濾袋將承受很高的過濾負荷，導致濾料的負荷變化循環太高，這樣也會縮短除塵布袋使用壽命。而在線清灰每次只是降低一行除塵濾袋的阻力，除塵器內部的其他眾多數量的濾袋仍然會連續進行過濾工作，這樣對剛噴吹后的濾袋所承受的過濾負荷變化相對來說比較溫和。因此，如果吸塵器的處理風量小，內部結構無法區分為4~10個以上的袋室數量，則不應采用離線灰塵。大型吸塵器內部的煙氣移動速度，過濾風速一般在1.5m/min以下，與吸塵器的入口濃度相比，二次揚塵不是非常嚴重的現象。可以用離線清灰。兩種清灰方法中，中小型吸塵器(10萬m3/h處理風量以下)單元采用在線清灰和定時或壓差脈沖控制，確保吸塵器的阻力。
離線灰塵的優點:
1、穿過濾袋的高壓脈沖空氣量不必很大即可有效清灰，且所需壓力較低。
2、從濾袋表面清掃的粉塵有足夠的時間落入灰斗，再次飛揚的概率很低。
3、清灰頻率下降，濾袋壽命延長。
4、配置脈沖閥數量少，可減少一次投資和維護工作量。
5、清灰所需的壓縮空氣量少，節約電力。
6、清灰效率高，除塵器能保持較低的壓力降，其結果是使除塵系統的運行費用下降。
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